Джек и Бен пытаются вернуть на остров тех, кто покинул его вместе с Кейт, Саидом, Хёрли и Аароном. Им приходится разыскивать разбросанных выживших, заново собирать хрупкий союз и принять условия опасного плана. Тем временем Сойер, Джульет, Локк и Джин переживают непредсказуемые скачки времени: остров меняет эпохи, а знакомые места и люди становятся чужими. Десмонд ищет мать Фарадея, а Кейт сталкивается с угрозой потерять Аарона.

Сойер и Джульет переживают скачки времени и встречают Других.
Хёрли и Саид скрываются от полиции, пока Кейт защищает Аарона.
Десмонд ищет мать Фарадея, способную помочь островитянам.
Локк, Джек и Бен собирают выживших для возвращения на остров.

Пятый сезон заметно меняет правила «Остаться в живых»: островная тайна превращается в историю о времени, причинности и цене попытки исправить прошлое. Герои оказываются в разных исторических периодах, а рядом с мистическими загадками появляются лагеря и порядки проекта «Дхарма». Вне острова тем временем нарастает нервный триллер с полицией, адвокатами и поиском тех, кто нужен для возвращения. Тон становится стремительнее и мрачнее, но личные конфликты Джека, Кейт, Сойера, Джульет и Бена не уступают место фантастике.